復合肥具有養分含量高、副成分少且物理性狀好等優點，對于平衡施肥，提高肥料利用率，促進作物的高產穩產有著十分重要的作用。但它也有一些缺點，比如它的養分比例總是固定的，而不同土壤、不同作物所需的營養元素種類、數量和比例是多樣的。因此，使用前最好進行測土，了解田間土壤的質地和營養狀況，另外也要注意和單元肥料配合施用，才能得到更好的效果。
隨著糧食產量的提高，土壤缺素的現象已經表現出來，現在農民開始更多地選用多元復合肥。
目前，復合肥的發展具有三大趨勢：第一是多品種專用化。不同作物有不同的專用肥，專用肥是根據作物生長發育規律和吸肥量研制生產的。農民在選用復合肥時，要根據不同作物選擇相應的專用肥。如果不是專用就違背了作物吸肥規律，使作物的增產潛力得不到發揮，同時造成某些營養元素浪費。第二是多功能藥用化。將農藥和化肥結合到一起，免去藥劑拌種程序，一次施用既能保證作物所需養分又能防治地下害蟲和苗期病害，可起到多重效果。第三是高濃度長效化。隨著農業生產的發展，高濃度長效化的復合肥越來越受到農民歡迎，這種類型肥料的應用減少了施肥用量，方便耕作，免去追肥環節，減輕了勞動量，提高了肥料利用率，省工、省力、省時，提質增效。
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